只有水门从林飞那里得到了消息，他和三代目听取了止水的汇报，宇智波武斗派中了群体别天神，已经决定放弃叛逃的计划，将来会逐渐向村子的方向靠拢。
水门对止水大加赞赏，还奖励他选一门禁术。日斩表面上很慈祥，心里却总觉得不对劲。
他一出来就去找老哥们团藏，可是留守的根忍说团藏大人出村去执行秘密任务了。
日斩也分不清这是托辞还是实情，只好回家等待。这一等就等到纲手出现在村口堵门。
纲手身后还跟着自来也这个壮丁，他们面前放着团藏和一群根忍的尸体，还有各种证物，宣称团藏要暗杀纲手，夺取她的身体做木遁细胞的实验。
根忍利用纲手晕血的弱点，差点就得逞，还好自来也及时赶到，帮助纲手斩杀所有刺客，解除伪装才发现是团藏和根忍。
这个消息实在太炸裂了，村口广场在极短的时间内就挤满了村民和忍者，热闹程度堪比大战的出征和凯旋。
事实上，团藏那半身伸出尖锐木刺的尸体已经是最有力的证据，何况还有各种机密档案佐证。
猿飞日斩带着所剩无几的直属暗部赶到之时，知道事情已经无可挽回了。
水门姗姗来迟，带领暗部维持秩序，并承诺一定会查明真相，给纲手和大家一个公道。
日斩知道团藏绝对不会干刺杀纲手这种傻事，要干早干了，恐怕是因为别的原因栽了。不过他也无从辩解，只怕其中有牵涉到自己的证据。
好在他得到自来也和水门的眼神暗示，知道徒弟和徒孙应该会给自己这个退休老头保留情面。
事实上，水门今天一早就根据林飞的情报，控制了所有根部忍者和据点，特别是不在明面上的那些。
其中一些罪大恶极且无可救药的根部忍者会被处死，其他人会回归各自的家族，转为普通忍者，或者被吸收进入暗部。
第二天开始，火影大楼陆续公布了根部逼迫忍族的罪证，然后一处孩童的乱葬坑被挖出来，再是以旗木朔茂为首的一些冤案被洗清，野乃宇的母亲也在其中。
在忍族和上忍代表会议上，水门还小范围展示了水户门炎和转寝小春配合团藏挪用资金和物资的证据，两位长老当场引咎辞职，日斩也宣布隐退。
在场众人知道木叶真正的权力交接初步完成了，都开始猜测新的长老团会怎样组成。
反观林飞和药师野乃宇，这场轩然大波真正的始作俑者，此时正在墓园里安静地祭奠。
野乃宇的母亲以前都没有坟墓，连衣冠冢都没有。这次她挖出儿时埋起来的几个发卡，给母亲立了一个墓，墓碑上写着：“一个苦命的女人，一个坚定的妈妈。”
野乃宇敬献上杀手的头骨和团藏的指骨，痛痛快快哭了一场，整理好妆容后，陪着林飞来到旗木家的墓地。
林飞穿越后还是第一次到这里来，用白牙短剑修剪好坟头的杂草，他看着孤零零的几个坟冢，才想起旗木一族的祖坟在大名府，祖上长期是大名的护卫武士。
朔茂这一支虽然人丁不旺，也算是旗木本家，而且声名显赫。旗木朔茂自从被大名赐予火影半袖之后，就成为了木叶高层的眼中钉，这是悲剧的源头。
不过这些和林飞的关系都不大，他只是觉得占了卡卡西的身体，可以帮他消除一些遗憾。